Bij $ \subset $ is er sprake van twee verzamelingen maar bij $ \in $ gaat het om een element (bijvoorbeeld een getal) en een verzameling. Dat is dan iets anders! Dus $\mathbf{N}\subset\mathbf{Z}$ lijkt me prima omdat $\mathbf{N}$ en $\mathbf{Z}$ beide verzamelingen zijn, maar $\mathbf{N}\in\mathbf{Z}$ klopt niet. In $\mathbf{Z}$ zijn de elementen gehele getallen en geen verzamelingen.
Dat {1,2} $\in$ {1,2,3,4} is dus onzin maar {1,2} $ \subset $ {1,2,3,4} is prima.
Je kunt wel een verzameling van verzamelingen hebben. De elementen zijn dan verzamelingen en een deelverzameling is dan ook een verzameling van verzamelingen.